Mutaciones en genes gyrA y gyrB en cepas de bacilos Gram negativos aisladas en hospitales chilenos y su relación con la resistencia a fluoroquinolonas / Mutations in gyrA and gyrB genes among strains of Gram-negative bacilli isolated from Chilean hospitals and their relation with resistance to fluoroquinolones

Background: A progressive frequency of resistance to fluorquinolones is observed among Gram-negative bacilli. Aim: To investigate the mechanism of resistance to fluoroquinolones mediated by mutations affecting gyrA and gyrB genes in strains of Gram negative bacüli isolated from CMean hospitals. Material and method: Minimal inhibitory concentration of fluoroquinolones was determined in 91 randomly selected nalidixic acid-resistant strains of Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa, isolated from hospitals of 12 Chilean cities. Quinolone resistance determining region (QRDR) was amplified by PCR and mutations were determined by restriction fragment length polymorphism (RFLP) and DNA sequencing. Results: Strains with mutation in codon 83 of gyrA showed decreased susceptibility to ciprofloxacin with MICs ranging from 0.25 to 1024 fig/ml. The sequencing of PCR products for gyrA indicated amino acid changes in the QRDR region. One strain ofE. coli presented a double mutation, in codon 83 Ser to Leu as well as in codon 87 Asp to Asn. In strains ofK. pneumoniae, however, the change of codon 83 was Ser to Tyr, in A. baumannii was Ser to Leu and in P. aeruginosa was Thr to He. No strains with mutations affecting gyrB were found. Conclusions: Mutations in codon 83 of gyrA is a frequent genetic event involved in the mechanism leading to decreased susceptibility to fluoroquinolone in strains of Gram-negative bacilli.

Identificación molecular de enzimas modificantes de aminoglucósidos en cepas de Enterococcus spp. aisladas en hospitales de la Octava Región de Chile / Molecular identification of aminoglycoside-modifying enzymes among strains of Enterococcus spp. isolated in hospitals of the VIII Region of Chile

Background: Infectious diseases produced by Enterococcus spp, must be treated with a synergistic combination between a penicillin and an aminoglycoside. High level resistance to aminoglycosides is a serious therapeutic problem, since it predicts the loss of synergistic activity of this antimicrobial combination. Aim: To investigate the presence of genes encoding aminoglycoside-modifying enzymes (AMEs) among strains of Enterococcus spp with high level of resistance to aminoglycosides. Material and methods: The genes encoding some of the AMEs were investigated among 305 aminoglycoside-resistant strains of Enterococcus spp isolated in hospitals of the VIII region of Chile, by dot blot hybridization and Polymerase Chain Reaction (PCS). Results: High level resistance to some aminoglycosides was observed in 104 strains (34.1 percent) and 93 of these harbored at íeast one of the genes encoding the investigated AMEs. Three genes were detected: aac(6)Ie-aph(2")Ia (14.8 percent) encoding for the enzyme AAC(6)Ie-APH(2")Ia (resistance to all aminoglycosides, except streptomycin); aph(3)IIIa (26 percent), and ant(6)la (28.5 percent) encoding for the phosphorylating enzymes APH(3)Ilia (resistance to kanamycin, amikacin and neomycin), and ANT(6)-la (resistance only to streptomycin), respectively. None of the strains harbored the gene ant (4) which encode for the enzyme ANT (4). Conclusion: The low frequency of strains harbouring the bifunctional enzyme (<15 percent), conferring an extended resistance profile to aminoglycosides, allows us to propose the empirical use of aminoglycoside-aminocyclitols, associated to a penicillin, in the treatment of serious infections produced by species of enterococci.

Producción de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) en cepas de Acinetobacter baumannii aisladas en hospitales de la VIIIª Región, Chile / Extended spectrum ß-lactamases (ESBL) production in Acinetobacter baumannii strains isolated from Chilean hospitals belonging to VIII Region

The resistance of Acinetobacter baumannii to ß-lactam antibiotics is mainly due to the synthesis of ß-lactamases. From a clinical point of view, this bacteria and others, grouped under the acronym SPACE (S: Serratia, P: Pseudomonas, A: Acinetobacter, C: Citrobacter, E: Enterobacter) are essentially Amp-C ß-lactamases producers. There is no local information about ESBL presence in Acinetobacter. We studied ESBL production using the Ho and col. technique modified by adding cloxacillin as chromosomal ß-lactamases inhibitor. From 69 isolates, with resistance to at least one third generation cephalosporin, only 7 showed positive synergy test. Four of these amplified for TEM family gene, and one of these amplified also for the OXA family. Our study found a low ESBL production percentage, which agrees with the premise of Amp-C as the main mechanism of resistance to ß-lactam antibiotics in A. baumannii. However, the ESBL description in these bacteria emphasizes the capacity of expressing multiple resistance mechanisms.

La resistencia de Acinetobacter baumannii a antimicrobianos ß-lactámicos se debe fundamentalmente a la síntesis de ß-lactamasas. Del punto de vista clínico se considera que esta bacteria, y otras agrupadas en el acrónimo SPACE (Serratia, Pseudomonas, Acinetobacter, Citrobacter, Enterobacter), son predominantemente productoras de ß-lactamasas tipo AmpC. No hay información en nuestro país sobre presencia de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) en Acinetobacter. Se estudió la producción de BLEE en cepas de Acinetobacter, mediante una modificación de la técnica de Ho y col adicionando cloxacilina como inhibidor de ß-lactamasas cromosomales. De 69 cepas con resistencia al menos a una cefalosporina de tercera generación, sólo siete presentaron sinergia positiva. Cuatro cepas amplificaron por RPC un fragmento intragénico de genes de familia TEM y una de ellas amplificó, además, para el gen de la familia OXA. Se evidenció un bajo porcentaje de producción de BLEE, lo que confirma que la producción de Amp-C es el principal mecanismo de resistencia de A. baumannii a ß-lactámicos. Sin embargo, la descripción de BLEE en esta bacteria, enfatiza su capacidad de albergar múltiples mecanismos de resistencia.

Aminoglucósidos-aminociclitoles: características estructurales y nuevos aspectos sobre su resistencia / Aminoglycosides-aminocyclitols: structural characteristics and new aspects on resistance

Los antimicrobianos aminoglucósidos-aminociclitoles constituyen una de las familias de agentes antibacterianos de mayor actividad sobre bacilos gramnegativos aeróbicos. Estos compuestos están característicamente formados por la combinación de un alcohol cíclico aminado (aminociclitol) y aminoazúcares (aminoglucósidos) unidos por enlaces glucosídicos. La potente actividad bactericida de estos compuestos parece no sólo explicarse por su capacidad de inhibición de la síntesis proteica, sino que también por un efecto sumatorio y pleiotrópico que altera la permeabilidad de la membrana citoplasmática. La penetración de estos antibacterianos en células bacterianas ocurre mediante tres fases bien definidas, siendo las dos últimas dependientes de la fuerza protón motriz (FPM). Este hecho explica la ausencia de actividad de estos compuestos sobre bacterias anaeróbicas. La resistencia bacteriana a este grupo de antibacterianos se debe, principalmente, a la producción de enzimas modificantes de aminoglucósidos. Estas enzimas son normalmente codificadas por elementos extracromosomales tales como plßsmidos y transposones. Sin embargo, se han identificados nuevos mecanismos y elementos genÚticos que participarían en los fenómenos de resistencia. Recientemente se ha descrito la metilación de bases involucradas en la unión entre el ARN 16S y el aminoglucósido, lo que implicaría un nuevo mecanismo de resistencia contra esta familia de antimicrobianos. Por otra parte, los cassettes genéticos adquieren una creciente importancia ya que albergan genes de resistencia a múltiples familias de antibacterianos, entre ellos, los aminoglucósidos-aminociclitoles. Estos cassettes genÚticos se encuentran asociados a integrones, los cuales son capaces de captar estos determinantes de resistencia.

Metodología clásica y molecular en la identificación de especies de enterococcus spp / Classic and molecular methodologies for the identification of enterococcus species

Background: Enterococcus is a bacterial genus with low virulence. However, in the last years, the importance of some enterococcus species as nosocomial pathogens has increased, specially due to their resistance to some antimicrobial. Aim: To identify enterococcus strains using classical biochemical techniques and genomic amplification with Polymerase Chain Reaction (PCR). Material and methods: Three hundred and five enterococcus strains, isolated between 1996 and 1999, from different clinical specimens in hospitals and other centers of the VIIIth Region of Chile, were studied. The isolates were identified, to the species level, according to the scheme proposed by Carvalho et al. Identification of some strains was confirmed by PCR. Results: Eighty nine percent of isolates were identified as E fócalis, 10.2 percent as E fócium and 3.3 percent as other species. Conclusions: PCR is a fast and promising technique, useful in the identification of Enterococcus species

Aislamiento de enterococcus faecium resistente a vancomicina con genotipo vanB en el Hospital Clínico Regional de Concepción / Isolation of vancomycin resistant enterococcus faecium with genotype vanB at the Hospital Clínico Regional de Concepción

La resistencia bacteriana a los agentes antimicrobianos ha aumentado durante las últimas décadas. De particular importancia es la descripción de aislamientos de Enterococcus resistente a vancomicina (EVR), de reciente y progresiva descripción en nuestro país. Comunicamos el aislamiento de dos cepas de E. faecium resistentes a vancomicina de pacientes colonizados por este microorganismo en el Hospital Clínico Regional de Concepción. El estudio feno y genotípico fue positivo para vanB, además ambos aislamientos presentaron similitud genética en un estudio de tipificación molecular por rep-PCR. Interesantemente el aislamiento de estas cepas precedió al aislamiento de EVR según el protocolo ministerial. Esta diferencia puede explicarse por los factores de riesgo que presentaron los pacientes estudiados

Aislamiento de acinetobacter spp desde muestras clínicas en el Hospital Clínico Regional Guillermo Grant Benavente en Concepción / Isolation of acinetobacter spp from clinical specimens at Hospital Clinico Regional Guillermo Grant Benavente, Concepción

Debido a que Acinetobacter se ha transformado en un importante patógeno intrahospitalario el objetivo de este estudio fue investigar las especies de este género que se encontraban involucradas en procesos infecciosos en el principal centro hospitalario de la ciudad de Concepción, en el periodo comprendido entre agosto y diciembre de 1999. Se recolectaron 113 cepas de Acinetobacter, aisladas principalmente de secreciones del tractorespiratorio y heridas. El mayor número de aislamiento tuvo su origen en pacientes internados en la unidad de cuidado intensivo, seguido de pacientes que se encontraban en los servicios de traumatología y cirugía. La identificación de especie y la biotipificación de Acinetobacter baumannii se realizó mediante pruebas fenotípicas. A. baumannii fue la especie predominante, siendo los biotipos 9,6 y 8 los prevalentes en este centro hospitalario